broiler Raw sequence reads-cecal contents. gut metagenome

NIAID Data Ecosystem2026-03-13 收录

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA876778

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Microflora assay

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2022-09-05

Data from: The cancer microbiome atlas (TCMA): A pan-cancer comparative analysis to distinguish organ-associated microbiota from equiprevalent contaminants

Studying the microbial composition of internal organs and their associations with disease remains challenging due to the difficulty of acquiring clinical biopsies. We designed a statistical model to a

DataCite Commons2022-11-04 更新710

QIIME 2 2025.4 Chinese Protocol

本文介绍了 QIIME2 的安装方法和标准分析工作流程，使同行能够快速上手。它还解释了中间步骤和参数，指导用户优化这些参数以获得更准确的结果。此外，我们总结了软件安装和使用过程中遇到的常见问题和解决方案，包括数据导入和导出、特征表生成、alpha 和 beta 多样性分析、物种组成分析、物种比较分析和下游可视化。提供补充材料，包括视频、分析代码、测序数据和预期结果，以促进分析和复制分析过程。

DataCite Commons2025-06-01 更新330

舞毒蛾幼虫肠道微生物组原始数据

通过分析肠道菌群在舞毒蛾应答病原真菌过程中的作用，利用16s-Miseq测定了球孢白僵菌侵染五龄幼虫24，48，72小时后肠道菌群结构和数量发生显著变化。数据包括肠道微生物测序96万条,3.29G

国家林业和草原科学数据中心2022-11-01 更新210

ASV table

Count table for ASVs generated from DADA2 from raw MiSeq reads. Rows are individual samples and columns are individual ASVs. This table underlies nearly all analyses. Can be loaded into R using read.R

DataONE2018-01-23 更新400

ASV table, taxonomy table and metadata

Table of amplicon sequence variants (ASV), corresponding taxonomy assignment and metadata. Dataset is ready for analysis in the MicrobiomeAnalyst package

Mendeley Data2024-01-31 更新240