RMSD values of the equilibrium and allosteric models.
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RMSD values of all backbone atoms with respect to the corresponding starting structures for the CMD simulations of (A) O-eIF4A, (B) ATP+RNA+C-eIF4A, (C) ATP+eIF4A and (D) RNA+eIF4A models, and for the TMD simulations of (E) the (ATP+eIF4A)+RNA→(ATP+RNA+C-eIF4A) transition and (F) the (RNA+eIF4A)+ATP→(ATP+RNA+C-eIF4A) transition.
本数据集涵盖两类分子模拟体系中所有主链原子相对于对应起始结构的均方根偏差(Root Mean Square Deviation,RMSD)值:其一为经典分子动力学(Classical Molecular Dynamics,CMD)模拟,涉及(A) 空载eIF4A(O-eIF4A)、(B) 三磷酸腺苷(ATP)+核糖核酸(RNA)+C-eIF4A、(C) ATP+eIF4A及(D) RNA+eIF4A四种模型;其二为过渡分子动力学(Transition Molecular Dynamics,TMD)模拟,包含(E) (ATP+eIF4A)+RNA→(ATP+RNA+C-eIF4A) 转变过程与(F) (RNA+eIF4A)+ATP→(ATP+RNA+C-eIF4A) 转变过程。
创建时间:
2016-02-23



