lncRNASNP

lncRNASNP v3 provides comprehensive resources of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in lncRNAs, including the information of SNPs in lncRNAs, SNP effects on lncRNA structure and lncRNA and eQTLs of lncRNAs. lncRNASNP v3 expands the species to eight eukaryotic species (human, chimpanzee, pig, mouse, rat, chicken, zebrafish, and fruitfly), updating the data and adding several new features. SNPs in lncRNASNP reached 67,513,785 and the human mutations reached 2,387,685, including 1,031,639 TCGA mutations and 1,356,046 CosmicNCVs.

lncRNASNP v3数据库提供了长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）内单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）的综合数据集资源，涵盖长链非编码RNA中的单核苷酸多态性信息、单核苷酸多态性对长链非编码RNA结构的影响，以及长链非编码RNA与表达数量性状位点（expression quantitative trait loci, eQTLs）的关联信息。lncRNASNP v3数据库将覆盖的物种范围拓展至8种真核生物，包括人、黑猩猩、猪、小鼠、大鼠、鸡、斑马鱼以及果蝇，同时完成了数据更新并新增了若干新功能。该数据库收录的长链非编码RNA相关单核苷酸多态性总量达67,513,785条，其中人类相关突变数据共计2,387,685条，包含1,031,639条TCGA突变数据与1,356,046条CosmicNCVs数据。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

lncRNASNP v3是一个专注于长非编码RNA（lncRNA）中单核苷酸多态性（SNP）的数据库，提供SNP对lncRNA结构、lncRNA:miRNA结合的影响以及突变对lncRNA表达的影响等信息。该版本扩展了物种范围至8种真核生物，并新增了疾病相关lncRNA和变异、lncRNA与药物的关联以及肿瘤和正常组织中的eQTLs等特性。数据库通过多个模块（如SNP、lncRNA、miRNA、突变、eQTL、疾病和药物）支持用户浏览和查询。