犬粪便痢疾志贺氏菌携带率研究数据

痢疾志贺氏菌是一类革兰氏阴性短杆菌，广泛存活于环境，粘膜，肠道中。痢疾志贺氏菌可导致细菌性痢疾，造成肠道感染。痢疾志贺氏菌可在人与宠物之间广泛传播，影响人类健康。了解犬粪便中痢疾志贺氏菌的携带率对于评估公共卫生风险具有重要意义，为疾病预防和控制提供科学依据，保障宠物及人类健康。犬粪便痢疾志贺氏菌携带率研究还可以为流行病学的研究提供数据支持，有助于确定中国本土区域宠物中痢疾志贺氏菌的本底流行水平，为判断后续可能出现的异常流行情况提供基线参照。1、数据采集：从宠物医院收集一批（1001只）犬粪便样本，按照1-1001的顺序进行样本编号，样本批次为KY1，并对基础信息、临床资料进行分析调查。2、数据检测：对收集到的1001只动物粪便样本分别进行16S微生物测序，按照16S微生物测序数据分析流程进行数据分析，在属水平上统计痢疾志贺氏菌检出量%，痢疾志贺氏菌检出量%大于0的样本检测结果标记为阳性，等于0 的检测结果标记为阴性。3、数据处理：① 统计阳性总数，平均携带率=阳性总数/样本总数；② 平均携带丰度%=AVERAGE(痢疾志贺氏菌检出量%)；③ 将痢疾志贺氏菌检出量按照从小到大的顺序排序，四分位数Q3= 3(n + 1)/4位置的检测数值，n为样本总数。 4、数据应用：利用PYTHON收集群体样本痢疾志贺氏菌检出量%，用MATPLOTLIB将该数据画出拟合图，便于研究人员观察分析。5、数据分类分级：将计算出的痢疾志贺氏菌检出量%进行指标评价，分为“高、中、低“不同的类别和级别（痢疾志贺氏菌检出量%值大于四分位数Q3的为“高”，大于0且小于等于四分位数Q3为“中”，值为0的为“低”）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

本数据集来源于对宠物医院1001份犬粪便样本的16S微生物测序检测，统计了痢疾志贺氏菌的检出量、阳性率及平均携带丰度，并根据检出量阈值将其划分为高、中、低三个等级。该数据旨在评估犬只携带痢疾志贺氏菌的公共卫生风险，为疾病预防与控制提供科学依据，同时为流行病学研究提供中国本土区域宠物中该菌的本底流行水平基线参照。