turmex2/pgc-anxiety

--- license: other tags: - gwas - polygenic-risk-score - psychiatric-genetics - pgc --- # Anxiety Disorders GWAS Summary Statistics (PGC) Mirror of Psychiatric Genomics Consortium (PGC) summary statistics for **Anxiety Disorders** (anx2026), redistributed in a single Apache Parquet file for use with [OpenMed Genomics](https://huggingface.co/spaces/turmex2/openneuro-genomics). ## Source - **Primary citation:** Levey et al., 2026 (pre-print); Purves et al., Molecular Psychiatry 2020 - **Original distributor:** Psychiatric Genomics Consortium (<https://pgc.unc.edu/for-researchers/download-results/>) This mirror exists only because the upstream OpenMed mirror became inaccessible. No modifications have been made to the underlying data; per-shard parquet files were concatenated into a single file for convenient streaming. ## File `pgc-anxiety_anx2026.parquet` -- one Apache Parquet file containing the full summary statistics table in the PGC's published schema (SNP, CHR, BP, A1, A2, FRQ, OR/BETA, SE, P, ...). ## Usage ```python import polars as pl df = pl.read_parquet( "https://huggingface.co/datasets/turmex2/pgc-anxiety/resolve/main/pgc-anxiety_anx2026.parquet" ) ``` ## License & terms of use PGC summary statistics are released for non-commercial research use only. Do not attempt to re-identify individuals. Results derived from these data are **not** a clinical diagnosis. See the original publication for the full data-use agreement.许可证：其他 标签： - 全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study，GWAS） - 多基因风险评分（Polygenic Risk Score） - 精神遗传学（Psychiatric Genetics） - 精神病基因组学联盟（Psychiatric Genomics Consortium，PGC） # 焦虑障碍全基因组关联研究汇总统计数据（PGC） 本数据集为精神病基因组学联盟（PGC）针对**焦虑障碍（anx2026）**生成的汇总统计数据的镜像副本，已被整合为单个Apache Parquet文件，适配[OpenMed Genomics](https://huggingface.co/spaces/turmex2/openneuro-genomics)工具的使用需求。 ## 数据来源 - **核心引用文献**：Levey等人，2026年（预印本）；Purves等人，《Molecular Psychiatry》，2020年 - **原始发布方**：精神病基因组学联盟（<https://pgc.unc.edu/for-researchers/download-results/>） 本镜像副本仅因上游OpenMed镜像无法访问而创建。原始数据未做任何修改，仅将分块存储的Parquet文件合并为单个文件，以方便流式读取。 ## 数据文件 `pgc-anxiety_anx2026.parquet` —— 单个Apache Parquet文件，包含采用PGC官方发布格式的完整汇总统计量表，字段包括：单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）、染色体（Chromosome，CHR）、碱基对位置（Base Pair，BP）、等位基因1（A1）、等位基因2（A2）、等位基因频率（FRQ）、优势比/回归系数（OR/BETA）、标准误（Standard Error，SE）、P值（P）等。 ## 使用方法 python import polars as pl df = pl.read_parquet( "https://huggingface.co/datasets/turmex2/pgc-anxiety/resolve/main/pgc-anxiety_anx2026.parquet" ) ## 许可证与使用条款 精神病基因组学联盟的汇总统计数据仅可用于非商业性研究用途。请勿尝试对个体进行重新识别。基于本数据集得到的结果**不得**作为临床诊断依据。完整的数据使用协议请参阅原始发表文献。