Gulosibacter sp. YIM M12148 Genome sequencing and assembly

NIAID Data Ecosystem2026-04-29 收录

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP322635

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资源简介：

For bacterial novel spices identification

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2021-08-01

BIGSdb

BIGSdb（Bacterial Isolate Genome Sequence Database）是一个用于存储和分析细菌基因组序列的数据库。它主要用于基因分型和序列分析，支持多种细菌基因组数据的存储和查询。

bigsdb.pasteur.fr4430

Mediterraneibacter sp.

The range of data encompasses taxonomy, morphology, physiology, sampling and concomitant environmental conditions as well as molecular biology.

DataCite Commons2025-04-09 更新1030

adamrian/petri-dish

该数据集根据培养皿中菌落的类型进行分类和隔离。具体分为三个类别：第一类包含铜绿假单胞菌（P. aeruginosa）和/或大肠杆菌（E. coli）菌落；第二类包含金黄色葡萄球菌（S. aureus）和枯草芽孢杆菌（B. subtilis）菌落；第三类则包含其他类型的菌落或无菌落的情况。

Hugging Face2023-12-12 更新740

AllTheBacteria

包含截至2023年6月的所有细菌WGS分离株INSDC数据，统一组装、质量控制、注释，可搜索。

github2024-05-22 更新1270

BacBench

BacBench是一个多尺度、多任务的基准，用于评估跨越细菌生命树的细菌基因组学的机器学习模型。目前BacBench包括6个从公共数据库收集和整理的任务：(1) 必需基因预测，(2) 操纵子识别，(3) 蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)，(4) 菌株聚类，(5) 抗生素抗性预测和(6) 表型性状预测。

github2025-05-28 更新900