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2016-2020年中国1型糖尿病患者血浆环状RNA芯片测序及分析

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数据内容:一般临床资料及化验结果;采集方案:记录并询问性别、年龄、病程、血糖控制及胰岛素使用剂量等一般临床资料;检测胰岛自身抗体、胰岛功能并记录化验结果。 circRNA芯片测序结果:将芯片扫描的图像导入到Agilent Feature Extraction软件中以进行原始数据提取。使用R软件包进行原始数据的分位数归一化和后续数据处理;miRNA反应元件预测:利用Arraystar公司自制miRNA靶标预测软件预测circRNA-miRNA的相互作用。circRNA-miRNA-mRNA网络的构建:通过TargetScan7.2软件预测了与circRNA相互作用的miRNA靶向的下游mRNA。利用候选circRNA,与其相互作用的miRNA和预测的下游mRNA之间的关系,构建circRNA-miRNA-mRNA网络。 KO和KEGG分析:利用候选circRNA及预测的下游靶mRNA进行注释,利用生物信息工具的数据库进行基因富集分析及代谢途径分析。

创建时间:
2022-01-12
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