TropGene Cotton

The data come from the TropGeneDB CIRAD information system (https://tropgenedb.cirad.fr/tropgene/JSP/index.jsp). TropGeneDB contains data from studies on tropical and mediterranean plants for various kinds of topics such as marker, QTL, genotype, genetic, phenotype, cartography (genetic, physical and linkage disequilibrium maps), linkage disequilibrium, association and germplasm. The plants concerned are banana, breadfruit, citrus, cocoa, coconut palm, cotton, oil palm, rice, rubber, sorghum and sugarcane. The IS has a database per plant. The data were produced by CIRAD researchers or by CIRAD researchers and colleagues associated in research projects. All The data have been published. The COTTON data in this dataset produced between 2008 and 2012 were extracted from the TROPGENE_COTTON database in tabulated text format files. There is a file for each type of data which name includes the data type. Each line of a file has several columns describing the study (title, description, year, country, place, contact) it belongs to. The tropgene_cotton_references‧txt file contains the references of the scientific publications on these data.本数据集源自国际农业研究与发展中心（CIRAD）的热带作物基因数据库（TropGeneDB）信息系统（https://tropgenedb.cirad.fr/tropgene/JSP/index.jsp）。热带作物基因数据库（TropGeneDB）涵盖针对热带与地中海植物的多维度研究数据，涉及分子标记、数量性状基因座（Quantitative Trait Locus, QTL）、基因型、遗传学研究、表型、图谱构建（含遗传图谱、物理图谱与连锁不平衡图谱）、连锁不平衡、关联分析以及种质资源等多个研究方向。该数据库覆盖的研究植物包括香蕉、面包果、柑橘、可可、椰子棕榈、棉花、油棕、水稻、橡胶树、高粱与甘蔗。该信息系统针对每种植物均设有独立数据库。本数据集的数据由CIRAD研究人员，或由CIRAD研究人员与其合作研究项目中的同行共同产生，且所有数据均已正式发表。本数据集内2008年至2012年产出的棉花数据，均从TROPGENE_COTTON数据库中以制表符分隔文本格式的文件提取得到。每种数据类型对应一个专属文件，文件名中包含对应的数据类型标识。文件内的每一行均包含多列字段，用于描述其所属研究的相关信息，包括研究标题、研究概述、发表年份、所属国家、研究地点与联系人。tropgene_cotton_references.txt文件则收录了与这些数据相关的学术出版物参考文献信息。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

TropGene Cotton数据集是一个专注于棉花研究的资源，来源于TropGeneDB CIRAD信息系统，涵盖了2008年至2012年间产生的多种遗传和表型数据，包括标记、QTL、基因型和表型等主题。数据以结构化文本格式存储，每个文件对应一种数据类型，并包含研究描述和参考文献，所有数据均已发表，适用于棉花遗传研究和育种应用。