EXPRESSO

EXPRESSO is a novel multi-omics database for exploration and visualization of multi-layered 3D genomic features across 46 different human tissues. Integrating 1360 3D genomic datasets (Hi-C, HiChIP, ChIA-PET) and 842 1D genomic and transcriptomic datasets (ChIP-seq, ATAC-seq, RNA-seq) from the same biosample, EXPRESSO provides a comprehensive resource for studying the interplay between 3D genome architecture and transcription regulation. This database offers diverse 3D genomic feature types and user-friendly interface for both data exploration and download.

EXPRESSO 是一款新型多组学数据库（multi-omics database），可用于探索并可视化覆盖46种不同人体组织的多层三维基因组特征。该数据库整合了来自同一生物样本的1360套三维基因组数据集（涵盖Hi-C、HiChIP、ChIA-PET）以及842套一维基因组与转录组数据集（包含ChIP-seq、ATAC-seq、RNA-seq），为研究三维基因组架构与转录调控之间的相互作用提供了全面的研究资源。本数据库提供丰富多样的三维基因组特征类型，并配备用户友好型界面，支持数据探索与下载功能。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

EXPRESSO是一个多组学数据库，旨在探索和可视化人类46种组织中多层三维基因组特征及其与表观基因组和基因表达的关联。该数据库整合了来自相同生物样本的1360个三维基因组数据集和842个一维基因组与转录组数据集，提供统一处理的数据、多种三维基因组特征、多组学分析工具、交互式可视化以及REST API访问功能。