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Pearl River estuary microbiome and virome

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DataCite Commons2025-06-01 更新2024-07-28 收录
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资源简介:
<b>Project description:</b> Deep metagenomic sequencing on microbial and viral communities in surface waters of the Pearl River estuary (PRE), a typical subtropical. <b>Data description: </b>Data for assembly, MAGs, viral like contigs and populations generated using the PRE microbial metagenomic data sets - data includes:PRET1608S??F00_idba-ud_final.fna.gz: the contigs generated from virome(&lt;0.2 μm) (5 files)PRET1608S??F0{2/7}_megahit_final.fna.gz: the contigs generated from cellular metagenome(0.2-0.7 μm and 0.7-2.7μm) (10 files)PRE_viral_contigs.fasta: Putative viral contigs identified from contigs of all the three size fractions in PRE (1 file\)PRE_viral_contigs_95-80.fna: Viral populations based on 95% nucleotide identity and 80% of the genome coverage criterion ((1 file)

项目描述:对典型亚热带珠江口(Pearl River Estuary, PRE)表层水体中的微生物与病毒群落开展深度宏基因组测序。 数据描述:基于珠江口微生物宏基因组数据集生成的组装结果、宏基因组组装基因组(Metagenome-Assembled Genomes, MAGs)、类病毒重叠群及病毒种群相关数据,具体包含以下文件: PRET1608S??F00_idba-ud_final.fna.gz:从病毒组(<0.2 μm)样本中组装得到的重叠群(contig,共5个文件) PRET1608S??F0{2/7}_megahit_final.fna.gz:从细胞型宏基因组(0.2~0.7 μm及0.7~2.7 μm组分)中组装得到的重叠群(共10个文件) PRE_viral_contigs.fasta:从珠江口三个粒径组分的重叠群中鉴定得到的推定病毒重叠群(共1个文件) PRE_viral_contigs_95-80.fna:基于95%核苷酸一致性与80%基因组覆盖度标准构建的病毒种群数据集(共1个文件)
提供机构:
figshare
创建时间:
2021-09-15
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