antiSMASH Database

antiSMASH是一个微生物次级代谢产物基因簇数据库。该数据库由丹麦技术大学、瓦赫宁根大学等机构的研究团队开发，主要收录古菌、细菌和真菌基因组中的生物合成基因簇预测数据。最新版本为第5版，包含来自55,054个高质量微生物基因组的近50万个BGC区域，为天然产物发现和抗生素研发提供数据支持。

antiSMASH is a database for microbial secondary metabolite biosynthetic gene clusters. It was developed by research teams from institutions including the Technical University of Denmark and Wageningen University. The database primarily collects predicted biosynthetic gene cluster (BGC) data from archaeal, bacterial and fungal genomes. Its latest version is Version 5, which contains nearly 500,000 BGC regions sourced from 55,054 high-quality microbial genomes, providing data support for natural product discovery and antibiotic development.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

antiSMASH数据库版本5是一个专注于次级代谢物分析的资源，提供预计算的antiSMASH结果和高级查询功能。它允许用户按系统发育或代谢物类型浏览生物合成基因簇预测、构建特定查询、进行蛋白质序列搜索，并查看统计摘要。该数据库最后更新于2025年11月15日，旨在支持研究人员探索生物合成多样性。