WGVD：小麦基因组数据库

<p>西北农林科技大学小麦变异数据库包含968个小麦种质的重测序和外显子测序的数据，变异包括7,353,314 SNPs 和 1,044,400 indels，并提供了小麦群体选择信号的统计（Pi和FST）和展示。</p>
<p>发布于 2017-07-07</p>
<p>Wang, Jierong, et al. "WGVD: An integrated web-database for wheat genome variation and selective signatures." <em>Database</em> 2020 (2020): baaa090. DOI: <a href="https://doi.org/10.1093/database/baaa090" target="_blank" rel="nofollow noopener">10.1093/database/baaa090</a></p>
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<p>西北农林科技大学构建的小麦变异数据库收录了968份小麦种质的全基因组重测序与外显子组测序数据，共鉴定得到7,353,314个单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs）与1,044,400个插入缺失（Insertion-Deletion，indels），并配套提供小麦群体选择信号的统计分析，涵盖核苷酸多样性（Nucleotide Diversity，Pi）与群体分化系数（Fixation Index，FST），同时支持可视化展示。</p><p>本数据库于2017年7月7日正式发布。</p><p>王洁荣（Jierong Wang）等. WGVD：小麦基因组变异与选择特征整合型网络数据库[J]. <em>Database</em> 2020(2020): baaa090. DOI: <a href="https://doi.org/10.1093/database/baaa090" target="_blank" rel="nofollow noopener">10.1093/database/baaa090</a></p><p>&nbsp;</p>

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

WGVD是一个全面小麦基因组变异数据库，专注于基因区域和上下游区域，包含超过734万个SNPs和104万个indels，基于968个个体的测序数据。它提供变异搜索、基因组标记分析、浏览器和BLAST工具，支持小麦育种深度研究，并涵盖不同小麦群体的选择性标记评估。