Comparative Toxicogenomics Database

Comparative Toxicogenomics Database (CTD) 是一个整合化学物质、基因、功能表型和疾病之间相互作用数据的数据库。该数据库自2004年发布以来，提供了超过4664万条相互作用数据，包括230万种化学物质、46689个基因、4340个表型和7212种疾病信息。CTD主要用于查询与疾病相关的基因和化学物质，以及它们之间的相互作用关系，为疾病相关环境暴露因素及药物潜在作用机制研究提供支持。比较毒理基因组学数据库（Comparative Toxicogenomics Database，CTD）旨在深化学界对环境化学物质影响人类健康机制的认知。生物编目人员会从科学文献中手动编目化学物质-基因、化学物质-疾病以及基因-疾病的关联关系。随后，该核心数据将在数据库内部完成整合，以生成推断型化学物质-基因-疾病关联网络。此外，该核心数据还会与外部数据集（如基因本体论（Gene Ontology，GO）注释、通路注释）进行整合，以此预测不同数据类型间的多种新型关联。CTD一项独特且极具价值的特性，是通过数据整合生成的推断关联：通过识别化学物质、基因、疾病、通路以及GO注释之间此前未被发现的关联，它能够帮助研究者将既有知识转化为全新的研究发现——而若使用其他生物信息学资源，这类关联往往难以被察觉。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Comparative Toxicogenomics Database（CTD）旨在通过人工整理化学、基因和疾病之间的关联数据，促进对环境化学物质影响人类健康的理解。该数据库通过内部数据整合生成化学-基因-疾病网络，并结合外部数据集预测新型关联，其独特优势在于能够推断出其他生物资源中不易发现的潜在关系。