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Olive dataset

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Mendeley Data2024-05-10 更新2024-06-27 收录
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Material complementario para el TFM "Exploración funcional y alergénica de los tejidos reproductivos del olivo (Olea europaea)". inf_comp_01.pdf: informe PDF con las figuras complementarias (de la S1 a la S9) del enriquecimiento funcional de polen y semilla. inf_comp_02.html: informe HTML del script de R provisional que hemos usado para realizar correlaciones, agrupaciones (clustering) y redes con los datos de polen. inf_comp_03.html: informe HTML obtenido con el mismo script de R anterior para realizar correlaciones, agrupaciones (clustering) y redes con los datos de semilla. inf_comp_04.ods: informe ODS con cuatro pestañas que incluyen información sobre: ST1 → ortología Arabidopsis-Picual. id_Arabidopsis: identificador en Arabidopsis. id_Picual: identificador en Picual. ST2 → DEGs para la comparación P0H-P1H. Regulacion: Down cuando ese gen se activa y Up cuando el gen se reprime. id_Picual: identificador en Picual. ExprMed: valor de expresión media. Pvalue: valor de P. Pvalueadj: valor de P ajustado. ST3 → DEGs para la comparación P1H-P3H. Misma distribución que la anterior. ST4 → DEGs para la comparación P3H-P6H. Misma distribución que la anterior. ST5 → DEGs para la comparación P1H-P6H. Misma distribución que la anterior. ST6 → DEGs para la comparación T+End-EMBR. Misma distribución que la anterior

本资料为硕士学位论文《油橄榄(Olea europaea)生殖组织的功能与致敏性探究》的配套补充材料。 inf_comp_01.pdf:该PDF报告包含花粉与种子功能富集分析的补充图(编号S1至S9)。 inf_comp_02.html:该HTML报告对应本研究用于处理花粉数据以开展相关性分析、聚类(clustering)以及网络构建的临时R脚本结果。 inf_comp_03.html:该HTML报告使用前述同款R脚本生成,用于处理种子数据以开展相关性分析、聚类以及网络构建。 inf_comp_04.ods:该ODS报告包含4个工作表,具体信息如下: ST1:拟南芥(Arabidopsis)与皮夸尔(Picual)橄榄的同源基因信息,其中id_Arabidopsis为拟南芥基因标识符,id_Picual为皮夸尔橄榄基因标识符。 ST2:P0H与P1H两组比对得到的差异表达基因(Differentially Expressed Genes, DEGs)信息。基因调控标注规则:若该基因被激活则标记为Down,被抑制则标记为Up;包含字段如下:id_Picual(皮夸尔橄榄基因标识符)、ExprMed(平均表达量)、Pvalue(P值)、Pvalueadj(校正后P值)。 ST3:P1H与P3H两组比对得到的差异表达基因信息,字段分布与ST2一致。 ST4:P3H与P6H两组比对得到的差异表达基因信息,字段分布与ST2一致。 ST5:P1H与P6H两组比对得到的差异表达基因信息,字段分布与ST2一致。 ST6:T+End-EMBR组比对得到的差异表达基因信息,字段分布与ST2一致。

创建时间:
2023-06-28
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Olive dataset 数据集图片
背景与挑战
背景概述
该数据集是橄榄(Olea europaea)生殖组织功能与过敏性研究的辅助材料,包含花粉和种子的功能富集图、基于R脚本的相关性、聚类和网络分析报告,以及差异表达基因(DEGs)和直系同源数据表格。数据集主要用于支持硕士论文研究,聚焦于橄榄花粉和种子在基因表达层面的比较分析。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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