ChIPBase

ChIPBase 集成了大量公开的ChIP-Seq数据，包括来自转录因子和组蛋白修饰的实验数据。数据集覆盖了多种生物体和细胞类型，并对ChIP-Seq数据进行了详细的注释，包括结合位点（binding sites）、结合基因（target genes）和调控网络等信息。ChIPBase integrates a large volume of publicly available ChIP-Seq data, including experimental data from transcription factors and histone modifications. The dataset covers a wide range of organisms and cell types, and provides detailed annotations for the ChIP-Seq data, including information such as binding sites, target genes, and regulatory networks.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ChIPBase是一个集成大量公开ChIP-Seq数据的数据集，涵盖转录因子和组蛋白修饰实验，覆盖多种生物体和细胞类型，并对结合位点、靶基因及调控网络进行了详细注释。该数据集由中山大学和中国科学院上海生命科学研究院于2022年发布，旨在提供非编码RNA和蛋白质编码基因的转录调控图谱。